根據(jù)測土和作物種植，給農(nóng)民開施肥配方是測土配肥的第二個環(huán)節(jié)，不能開出科學(xué)有效的施肥配方，科學(xué)測土配肥失去了測土的目的和意義。科學(xué)施肥配方應(yīng)考慮以下十個因素。
1.作物的營養(yǎng)需求
科學(xué)配方要符合作物的營養(yǎng)需求曲線。由于不同作物品種有不同的營養(yǎng)需求曲線，所以要綜合考慮作物種類，不同品種、不同生育期的需肥特征進行推薦施肥。
2.作物的營養(yǎng)吸收能力、特征與調(diào)節(jié)技術(shù)
作物的吸收能力與作物品種和作物生物調(diào)節(jié)技術(shù)及土壤環(huán)境條件有關(guān)，不同的作物品種、不同的生物調(diào)節(jié)技術(shù)可以構(gòu)成不同的作物營養(yǎng)吸收能力。另外，不同作物吸收營養(yǎng)的方式、特征不同，如根的深度、分布不同，對施肥要求也不同。在測土配肥中不能單純的推算出一個數(shù)值，此外還要綜合考慮植物吸收特性產(chǎn)生的影響。
3.土壤的營養(yǎng)含量
科學(xué)測土配肥就是準(zhǔn)確測試具體地塊土壤基礎(chǔ)養(yǎng)分含量，根據(jù)作物目標(biāo)產(chǎn)量所需要的養(yǎng)分含量，估算出作物所需養(yǎng)分補充量，再結(jié)合當(dāng)?shù)馗鞣N實際影響因素確定合理有效的施肥比例、施肥量和施肥方法。
4.土壤的保肥、釋肥特征
科學(xué)配方要符合作物的土壤保肥、釋肥特征。土壤保肥性是指土壤能夠?qū)︷B(yǎng)分的吸收（包括物理、化學(xué)和生物吸收）和保蓄能力。肥料要發(fā)揮作用，首先要求土壤對其有保存作用，然后是要有一個好的釋放性能，才能保證作物的吸收量。然而，不同的土壤有不同的保肥釋肥性，因此在配方施肥中一定要認真考察分析改善土壤保肥釋肥性能以提高肥效。
5.肥料的營養(yǎng)含量、質(zhì)量和性價比
科學(xué)配方要根據(jù)具體的肥料質(zhì)量、營養(yǎng)含量和性價比來進行，目的是讓農(nóng)戶降低成本和增產(chǎn)增收。
6.肥料的流失特征
科學(xué)配方要考慮肥料在環(huán)境、土壤中的自然流失曲線和不同肥料摻混后的化學(xué)反應(yīng)流失。不同肥料的化學(xué)穩(wěn)定性不同，化學(xué)氮肥施入土壤后，植物對氮的吸收率一般僅為30%~50%，而且不同作物及同一作物不同品種之間，都有明顯差異。
7.肥料的釋放、吸收特征
科學(xué)配方要考慮不同肥料在環(huán)境、土壤中的不同釋放曲線和同一作物對不同肥料的吸收效率。養(yǎng)分含量相同的不同肥料可以有不同的肥料釋放和作物吸收曲線，從而構(gòu)成了不同肥料利用率、利用方式。
8.肥料的產(chǎn)品、增效技術(shù)
科學(xué)配方要考慮肥料的不同生產(chǎn)技術(shù)和增效技術(shù)構(gòu)成的肥料利用率。對肥料增效技術(shù)研究表明，施加肥料增效劑能顯著提高作物對養(yǎng)分的吸收量，并且土壤自身肥力也有所提高。可見，在配方施肥中應(yīng)充分考慮肥料增效劑的功效，施加增效劑與不施用增效劑相比，肥料利用率顯著提高，可以節(jié)省相當(dāng)大一部分肥料，在測土配肥過程中要根據(jù)是否加入增效劑來增減肥料用量。另外，不同的肥料生產(chǎn)技術(shù)和產(chǎn)品技術(shù)也會構(gòu)成不同的肥料利用效率，有些產(chǎn)品技術(shù)有明顯的提高肥料利用率的特點，如，生物調(diào)節(jié)技術(shù)、肥料增效技術(shù)、螯合技術(shù)、小分子（易吸收）生產(chǎn)技術(shù)。
9.氣候的影響因素
溫度、雨量、光照等主要氣候因素可影響作物對養(yǎng)分的吸收和肥料在土壤中的變化、流失及肥效發(fā)揮的快慢。溫度升高能促進肥料的分解，光照強弱也直接影響光合作用，水分對養(yǎng)分的吸收也起著至關(guān)重要的作用。因此科學(xué)配方要考慮環(huán)境氣候條件的影響。
10.施肥方法和手段
科學(xué)配方要考慮當(dāng)?shù)氐氖┓史椒ê褪侄巍ｋm肥料相同，但施肥方法、手段不同，肥料利用率也會不同。在推薦施肥中應(yīng)根據(jù)不同的作物不同的肥料選擇不同的施肥方法，不同施肥方法手段構(gòu)成了不同的肥料利用率，就應(yīng)采用不同的施肥量（施肥配方）。所以，科學(xué)測土配肥應(yīng)該包括施肥方法和手段的具體內(nèi)容，而光給出測土數(shù)據(jù)或是根據(jù)配方生產(chǎn)出復(fù)合肥推廣應(yīng)用，其效益就大大減小。
